1225年，蒙古已经占据了金国大部分地区，山东地区的势力也在宋金之间摇摆不定，最终还是投降于蒙古。而东辽为了自保，完全投靠蒙古，成为了蒙古的附属国。西辽灭亡后，花剌子模杀蒙古使团，引发了蒙古的第一次西征。随后，中亚被占领，花剌子模灭亡，中亚成为了察合台和窝阔台的封地。到1242年，窝阔台去世，西征宣告结束。在西边，派遣旭烈兀发动了第三次西征，征服了西亚广大地区。
12世纪，蒙古高原上群雄并起。西边有经济发达、文化先进的突厥乃蛮部，中部有盘踞已久的克烈部（铁勒—突厥）、南边有汪古部（沙陀）、北边有蔑儿乞部、林中百姓等铁部、回鹘部落，东边有塔塔尔部（鞑靼，靺鞨的一支）。蒙古部生活在蒙古高原中东部，其内部又分裂为诸多小部落，经常被塔塔尔部欺凌。
1206年，成吉思汗实现对漠北各部的统一，建立了蒙古汗国。当时，亚欧大陆各国都走向了衰落。金国从巅峰坠落，皇帝昏庸、官僚腐败、士兵怯战，已经病入膏肓；南宋偏安南方，权臣专政，皇帝懦弱；西夏享受了百年和平，早已没有当初的战斗力；西辽内部各国离心离德，试图脱离西辽控制。这给了蒙古崛起提供了机会。
1215年，蒙古经过10年的发展，版图开始扩张了。在北方，蒙古吞并了贝加尔湖西北的“林中百姓”各部，其势力范围开始扩展到北纬63度左右；在南方，对西夏发动战争，迫使西夏臣服；对金发动战争，占据燕京，迫使金国迁都开封；西域方面，高昌回鹘等投入蒙古怀抱。在东北地区，契丹人独立，重建辽国，史称“东辽”，而讨伐东辽的金国将领又在东北建立了“东夏”，从此金国四分五裂。
1225年，蒙古已经占据了金国大部分地区，山东地区的势力也在宋金之间摇摆不定，最终还是投降于蒙古。而东辽为了自保，完全投靠蒙古，成为了蒙古的附属国。在西域，蒙古吞并了西辽。花剌子模也崛起了，灭古尔王朝，统治河中地区和伊朗高原，迁都撒马尔罕，试图挑战蒙古。
西辽灭亡后，花剌子模杀蒙古使团，引发了蒙古的第一次西征。随后，中亚被占领，花剌子模灭亡，中亚成为了察合台和窝阔台的封地。在中原，铁木真于1227年灭西夏，窝阔台最终在1234年灭金国。这时候的蒙古已经开始建立中央集权，向帝国过渡。
1235年开始，蒙古开始了第二次西征，其目的是征服东欧的钦察部落和罗斯公国。到1242年，窝阔台去世，西征宣告结束。这一年，术赤之子拔都在东欧建立了钦察汗国，罗斯各国成为其附属国。钦察汗国也是最早从蒙古汗国中独立而出的汗国，代表蒙古分裂的开始。另外，蒙古在窝阔台时期还向东灭了东夏国，并不断进攻后高丽。
蒙哥在位期间，开始四面出击。在东边，征服了后高丽王朝，迫使其成为了附属国。在南边，征服了大理和吐蕃，实现了对南宋的战略包围。在西边，派遣旭烈兀发动了第三次西征，征服了西亚广大地区。不过，蒙哥在对南宋的战争遭遇挫折，最终死于钓鱼城下，南宋得以苟延残喘。
蒙哥去世后，爆发了阿里不哥和忽必烈的汗位之争，忽必烈代表漠南汉地势力，而阿里不哥代表传统保守势力，最终阿里不哥失败。而旭烈兀则趁机在西亚建立了伊尔汗国。汗位之争，加速了蒙古的分裂。
忽必烈击败阿里不哥后，实现了对漠北的控制，并在1271年建立了元朝。不过，中亚地区又出现了察合台汗国和窝阔台汗国，其中窝阔台的海都和忽必烈长期战争。使得元朝没有精力对付南宋，南宋得以继续延长一些时间。
1276年，元朝灭南宋，实现了中国的再次统一。随后，元朝继续扩张，在西部击败了海都，将高昌地区纳入版图；在东北征服了库页岛，并在黑龙江入海口设置征东元帅府。为了远征日本，在朝鲜半岛设置了征东行省。在西南灭缅甸蒲甘王朝，并设置了缅中行省。忽必烈还对越南、占城、爪哇等地发动战争，但是并未完全实现对这些国家的征服。察合台汗国也在扩张，兼并了伊尔汗国部分土地。
元朝中期的时候，窝阔台汗国灭亡，其土地被元朝和察合台瓜分。不久，察合台汗国也分裂为了东西两部分，很快西察合台汗国就瓦解了。伊尔汗国在14世纪中期瓦解。元朝方面，放弃了缅中行省，在缅甸推行土司制度。
