可以双方私下签订和解协议，此协议视为民事合同，双方有履行协议约定的义务。属于劳动纠纷应先申请工伤认定，再依法申请作出劳动能力鉴定，就鉴定结论要求赔偿，协商不成的提起劳动仲裁。申请行政复议根据有关规定，申请工伤认定的职工或者其直系亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的;工伤职工或者其直系亲属对经办机构核定的工伤保险待遇有异议的，可以依法申请行政复议。
一、发生了员工的工伤纠纷如何调解?
发生了员工的工伤纠纷可以在第三方的组织之下完成调解。可以双方私下签订和解协议，此协议视为民事合同，双方有履行协议约定的义务。若双方经劳动仲裁委会调解签订调解协议，这时的协议具有法律效力，若一方不履行则可直接申请书法院强制执行。
首先区分是工伤纠纷还是雇佣损害赔偿案件。两者的赔偿程序和标准有较大的区别，导致的赔偿金额也有差距。属于劳动纠纷应先申请工伤认定，再依法申请作出劳动能力鉴定，就鉴定结论要求赔偿，协商不成的提起劳动仲裁。(要有劳动关系证明才可以按照工伤处理)工伤的赔偿依据是本人工资和社平工资，起诉的被告是单位。
而属于临时性的劳务、雇佣行为，由雇主承担一定赔偿责任，协商不成可以直接起诉要求雇主承担赔偿责任。
二、工伤纠纷如何解决?
(1)申请行政复议
根据有关规定，申请工伤认定的职工或者其直系亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的;工伤职工或者其直系亲属对经办机构核定的工伤保险待遇有异议的，可以依法申请行政复议。
(2)提起行政诉讼
申请工伤认定的职工或者其直系亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的，工伤职工或者其直系亲属对经办机构核定的工伤保险待遇有异议的，在经过行政复议后，对行政复议还不服的，可以依法提起行政诉讼。
(3)申请调解、仲裁或者提起民事诉讼或者协商解决
职工与用人单位发生工伤待遇方面的争议，按照处理劳动争议的有关规定处理。
根据《劳动法》第77条规定，用人单位与劳动者发生劳动争议，当事人可以依法申请凋解、仲裁、提起诉讼，也可以协商解决。可见，就有关工伤待遇方面的争议，可以协商解决，申请调解、仲裁或者提起民事诉讼。需要指出的是，提起民事诉讼之前必须先经过仲裁，否则法院不予受理。
员工在用人单位工作的时候发生了工作性伤害，那么完全是可以通过合法的方式来解决的，比如说申请工伤认定，然后由工伤保险基金来负责赔付，当然了，如果劳动者和用人单位之间关于工伤问题发生了纠纷，之后，可以在第三方权威机构的组织之下完成调解。
