尚书台的地位逐渐下降，渐渐只能听命执行，不能参与决策。到了唐朝初年，仿照这五省六曹制，正式确立了三省六部制。六部的长官为尚书，副长官为侍郎。决策机构，长官为中书令，主要负责草拟、颁发皇帝诏令。审议机构，掌管为侍中，负责审查诏令，签署奏章，矫正错误，保证皇上诏令的准确无误。刑部，掌管法律、刑狱事务，审定各种法律，复核各地送部的刑名案件。
战国的时候，韩国设立了一个职位：少府。少府是管理皇室私财和生活事务的，可以说是皇室的私人秘书。秦汉之后，少府这个职位就一直延续，不过在一些朝代进行了改变，延伸到了国家管理上，直到元朝的时候被废除。
秦朝的时候，在少府中设置了掌管典籍文卷的官吏，称为尚书，也就是后来尚书省的出处。当时丞相府整理的关于各地情况的文书，都交给尚书，由尚书再转交给皇上。此时的尚书并无实权。
汉朝初期，由于丞相的权利过大，引起的皇上的不满，皇权和相权的矛盾日益尖锐，然后汉武帝开始削弱丞相的权利。汉武帝下令让三公之下的九卿越过三公，直接向皇上汇报，奏章由皇上直接审批。这样加强了中央集权，但是皇帝的工作量变得越来越大，皇帝便需要一个帮助他处理文书的秘书。皇帝身边，离得最近的，处理文书的，就是尚书，于是尚书便得到了皇上的宠信，开始为皇上批阅奏章。后来汉成帝将御史大夫由副丞相等级提升为丞相等级，进一步削弱丞相权利；又设置尚书台，扩大尚书的职权。慢慢的，三公（御史大夫、太尉、丞相）的权利被架空，尚书的权利越来越大。
东汉末年，曹操挟天子以令诸侯，为了培养自己的权利，设立了秘书令，掌管机密事务。曹丕建立魏国之后，尚书台的权利已经让他产生了戒心，为了削弱尚书台的权利，曹丕借用曹操所设的秘书令，成立中书令，设中书省，分离尚书台的职务。尚书台的地位逐渐下降，渐渐只能听命执行，不能参与决策。
东晋的时候，中书省的权利又让皇帝担忧，于是设立门下省，由侍中掌管，以削弱中书省的权利。南北朝的时候，为了减弱中书省和门下省的权利，把尚书台提升为尚书省。
自南北朝开始，三省格局形成，各自管理一部分中央事务。
隋朝时期，设立了五省六曹制，五省分别是内史省、门下省、尚书省、秘书省、内侍省。秘书省管理宫内书籍历法，内侍省主要管理宫中的宦官，是两个不干涉国家政务的部门。其他三个是政务机关。
到了唐朝初年，仿照这五省六曹制，正式确立了三省六部制。
后来的朝代，宋朝虽有三省，但主要职权转移到了其他机构，三省没有什么权利。元朝三省开始渐渐设立不全，有的皇帝使用其中的一省或两省。
三省从无到有，从私人秘书到管理国家政务，又到为了权利削弱做出的不断更改，说明所有的中央秘书，都只能是独裁者的工具。
二、管理制度的摸索，六部各司其职汉朝时，光武帝刘秀在尚书台下设立六个部门，统称为六曹尚书，每曹有尚书一人，进行管理。
三国魏国，尚书台下的曹数越来越多，于是让一曹统领数曹，总的统领还是六个曹。
隋朝的时候，六个部门被命名为吏部、度支、礼部、兵部、都管、工部。
唐朝时，度支改名为户部，都管改名为刑部，于是就有了吏、户、礼、兵、刑、工六部，六部都归属于尚书省之下。
此后六部一直延续到清朝。
六部的长官为尚书，副长官为侍郎。
三、三省职能中书省。决策机构，长官为中书令，主要负责草拟、颁发皇帝诏令。
门下省。审议机构，掌管为侍中，负责审查诏令，签署奏章，矫正错误，保证皇上诏令的准确无误。
尚书省。最高的行政机构，长官为尚书令，下属有左、右仆射协助。尚书省主要是执行国家政令，所以把吏、户、礼、兵、刑、工六部设在尚书省下进行管理。
皇上的命令从中书省起草，之后让门下省进行审核，最后交给尚书省去执行。这样可以避免权利集中到某一个部门手里，保证君主的独裁。
四、六部职能吏部。主要管理国家的官员体系，全国官吏的任免、升降、调动等事务，由吏部管辖。
户部。掌管古代和民生相关的东西，主要有户口信息、土地、赋税、财政、国家疆土等。
礼部。掌管和国家礼节相关的事务，如国家典章法度、祭祀、学校、科举、吉凶占卜、接待外宾等。
兵部，掌管军队相关事务，如武将选用、兵籍、军械、军令等。
刑部，掌管法律、刑狱事务，审定各种法律，复核各地送部的刑名案件。
工部，掌管全国的工程，山泽、屯田、工匠、水利、交通、各项工程等等，此外要管理度量衡和铸钱。
五、六部的古今对比吏部。中央组织部、人力资源和社会保障局。
户部。财政部、民政部。
礼部。中央宣传部、外交部、教育部、文化部。
兵部。国防部。
刑部。司法部、公安部。
工部。住房和城乡建设部、水利部、工信部、交通运输部。
